尽管低温湿式氧化方法的解决效率高，可是湿式氧化法在具体应用推广层面仍存在一定的局限，这是因为下列缘故：
1、低温湿式氧化一般要求在超高压高温条件下开展，其中间产物通常为有机物，故对系统原材料的要求很高，必须耐热、髙压，并抗腐蚀，因而机器设备花费大，全面的一次性投资高。
2、因为湿式氧化反映中应保持在超高压高温条件下开展，故仅适合低流量高浓度污水处理，针对较低浓度的大水流量的污水则很不经济。
3、即便在非常高的条件下，对于某些有机化合物如多环芳烃、小分子水羧基去除效果也是不太理想，很难做到彻底空气氧化。
4、湿式氧化环节中可能产生毒副作用更强大的中间产物。在湿式氧化法的前提下发展起来催化反应湿式氧化法，根据投加金属催化剂提升该方法的氧化能力、减少反映温度与工作压力，从而减少了投入和使用成本，扩张了这一技术的发展范畴，变成湿式氧化法科学研究热门话题。催化反应湿式氧化法常见的金属催化剂有Fe、Cu、Mn、Co、Ni、Bi、Pt等化学元素或在其中几类的元素组成。
5、因为反应釜归属于高压容器，因而操作失误容易造成安全生产事故。